接受超音波檢查的時候，常聽見醫師/超音波師提到卵巢"有水泡"，"有水瘤"或是"有囊腫"，什麼是水泡，水瘤，還是囊腫，大家總是有疑問。其實，只要是卵巢裡看到填充液體的囊狀物，皆可以稱為囊腫；就大方向來說，可分為功能性囊腫和病理性囊腫兩大類。臨床上，囊腫常常跟水泡，水瘤混稱；但是在稱呼使用上，水泡還是較常用於囊腫裡的「功能性囊腫」，尤其是濾泡囊腫。以下介紹囊腫的種類：
功能性囊腫
其來源是卵泡，正常情況下卵泡命運有兩種，一是在排卵釋出卵子之後形成黃體，沒有懷孕產生的人類絨毛膜激素支持下，約莫2週會萎縮消失；或是並未成為優勢卵泡情況下自然萎縮。但部分卵泡並未按照之前兩種情況發展時，便會成為功能性囊腫，根據其內容物可區分為濾泡性囊腫或黃體囊腫。未停經的女性卵巢發現的囊腫約80%是功能性囊腫，這些囊腫的特性為短期存在(約莫一到三個月內消失)，臨床上除非造成症狀，通常不需治療。另外一種較少見的為懷孕時因人類絨毛膜刺激卵泡而形成的卵囊黃體囊腫。
病理性囊腫
顧名思義就是非來自卵泡的囊腫，大多為良性，但仍有惡性之可能。其來源為卵泡旁的組織病理性變化，常見有以下幾類：
- 源自間皮細胞－包括漿液性囊瘤(serous cystadenoma)/ 黏液性囊瘤(mucinous cystadenoma)/子宮內膜異位瘤(Endometrioma)等。
- 源自生殖細胞－畸胎瘤(Dermoid cyst)等，其他無性細胞瘤(Dysgerminoma)等因內容物較為實質腫瘤，較少被稱為囊腫。
- 源自性腺間質－顆粒細胞瘤(Granulosal cell tumor)等，其他性腺間質細胞來源的腫瘤較少囊性表現。
大多囊腫沒有症狀，部分可能造成下腹疼痛，月經異常，腹部隆起，排便困難等症狀。臨床上最常用的診斷工具為超音波，當婦科醫師發現卵巢囊腫時，若非各項囊腫的典型特徵，通常會先區分是否有惡性的疑慮，若無惡性的疑慮，小於10 公分的囊腫大多可以先觀察3個月，追蹤超音波囊腫是否消失，以排除功能性囊腫的可能性；當有惡性疑慮時，則需進一步檢查腫瘤指數，甚至電腦斷層檢查以進一步鑑別診斷。
當診斷為良性病理性囊腫時，則根據超音波下卵巢囊腫的特質判斷進一步處置；大多數的囊病理性囊腫治療方式為手術移除。其中子宮內膜異位瘤，俗稱巧克力囊腫，因其形成原因其中一種理論為該囊腫為正常卵巢組織因內膜異位造成的慢性出血與發炎形成的假性囊腫，手術對正常卵巢組織傷害較大，與且未停經的情況下，即使手術也有機會復發，因此治療尚需配合個人的狀況減少需要反覆手術的可能性。一般建議手術的情況有以下幾種：
- 囊腫本身有變化，無法排除惡性之疑慮，需病理檢查。
- 無法忍受之經痛或慢性骨盆腔疼痛，年輕女性可考慮術後加上藥物治療以減少復發機率。
- 合併不孕的情況，仍考慮嘗試自然懷孕，目前文獻回顧手術可增加自然懷孕率。但此種狀況僅限於未曾因子宮內膜異位症開刀過的患者。
由於大多數的卵巢囊腫沒有症狀，婦科超音波檢查因不具太大侵略性也沒有輻射的疑慮，其實可以考慮列入健康檢查的項目，當有檢查到囊腫時，若檢查醫師判斷只需要後續追蹤時，大多無惡性的疑慮，且超過半數為功能性囊腫，不需過度擔心；但當合併嚴重急性腹痛時，應提早回診以排除需急性處置之可能性，例如囊腫破裂等。
